Therapeutic Microbiomics Research Group
The gut microbiome is a complex community of microorganisms that significantly influences the health and disease status of its host. Increasing evidence shows that this microbial community affects both acute and chronic conditions and has a profound impact on overall population well-being.
From antibiotic resistance to chronic intestinal inflammation, the gut microbiome offers an excellent field for discovering new interactions that can serve as the basis for innovative therapeutic approaches. In our group, we aim to understand the protective functions of the microbiota by identifying and manipulating its mechanisms, transforming this knowledge into breakthrough biotherapies that can substantially improve patients’ quality of life.
We combine classical microbiology and molecular biology techniques with innovative synthetic biology strategies and multi-omics approaches to better understand the functional aspects of microbiota and pathogens – from computational analyses and laboratory experiments to animal model studies – in order to uncover the true scope of these functional modifications.
Team members
Dr. Vitor Cabral
Vitor jest mikrobiologiem specjalizującym się w badaniach nad mikrobiomem jelitowym i jego potencjałem terapeutycznym. Jego prace badawcze koncentrują się na opracowywaniu nowatorskich terapii probiotycznych ukierunkowanych na stany zapalne i dysbiozę, a także na strategiach ograniczania rozprzestrzeniania się oporności na antybiotyki.
W Grupie Badawczej Mikrobiomiki Terapeutycznej (Therapeutic Microbiomics Research Group) prowadzone są badania nad cechami mikroorganizmów — zarówno indywidualnych, jak i w społecznościach (biofilmach) — które odpowiadają za patogenność lub funkcje ochronne. Celem tych badań jest opracowanie nowych testów prognostycznych i diagnostycznych oraz innowacyjnych terapii. Łącząc badania podstawowe i translacyjne z modelami uczenia maszynowego, zespół dąży do rozwoju nowej generacji terapii opartych na mikrobiomie.
Dr. Paula Czyszczoń
Paula uzyskała tytuł doktora nauk ścisłych i przyrodniczych o specjalności immunochemia w Instytucie Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk we Wrocławiu. Jej badania koncentrowały się na bakteryjnych pęcherzykach zewnątrzkomórkowych (OMV) izolowanych z Yersinia enterocolitica O:3 oraz ich oddziaływaniu z ludzkim układem dopełniacza.
W trakcie pracy doktorskiej zajmowała się analizą cukrowych antygenów powierzchniowych bakterii oraz OMV przy użyciu metod spektroskopowych i spektrometrii mas, badając ich wpływ na aktywację wrodzonej odpowiedzi immunologicznej oraz potencjalny udział w rozwoju sepsy, również w modelach in vivo. Kluczowym etapem jej badań była odpowiednia preparatyka oraz analiza OMV z wykorzystaniem metod fizykochemicznych, w tym cytometrii przepływowej.
Ukończyła liczne staże w jednostkach naukowo-badawczych i laboratoriach diagnostycznych (posiada tytuł magistra mikrobiologii), w tym półroczny staż na Wydziale Biologicznym Uniwersytetu Barcelońskiego, gdzie specjalizowała się w analizach biologii molekularnej, oraz kilkumiesięczny staż na Uniwersytecie Islandzkim w Húsavíku.
In the Therapeutic Microbiomics Research Group, she serves as a postdoctoral researcher, studying the relationships between human microbiota microorganisms and the host, as well as the protective mechanisms and pathogenic traits of these microorganisms. In her research, she uses NGS techniques and phenotypic methods, continuing to develop her scientific interests in the field of microbiology.
Kinga Hupało
Kinga completed her life science studies at the University of Wrocław. While working on her master’s project, she gained practical skills at the intersection of molecular biology, genetic engineering, and medical biotechnology. She acquired her first professional experience as a laboratory technician in the Department of Toxicology at Wrocław Medical University. During this time, she also completed postgraduate studies in molecular biology at Jagiellonian University in Kraków, expanding her expertise in clinical research.
She joined the Therapeutic Microbiomics Research Group as a Lab Manager and is currently working with the team to build the laboratory from the ground up. Her daily responsibilities include budget planning, assembling laboratory reagents and equipment, and ensuring compliance with the requirements necessary to begin work with, among others, GMMs and GMOs. Ultimately, she will also support the team in the implementation of research and development projects.