Dzięki dofinansowaniu z MNiSW dr Paweł Sega buduje platformę BioValid, która umożliwi analizę mikroorganizmów na poziomie pojedynczych komórek.
Jeszcze kilka lat temu o mikrobiomie mówiło się głównie w środowisku naukowym. Dziś to jeden z dynamicznie rozwijających się obszarów badań biologicznych i medycznych.
– Mikrobiom to społeczność drobnoustrojów, które żyją razem z nami. Dlatego warto o niego dbać – podkreśla dr Paweł Sega, kierownik Laboratorium Diagnostyki Genetycznej i Mikrobiologicznej w Łukasiewicz – PORT.
Przez długi czas mikrobiom kojarzono przede wszystkim z układem pokarmowym i trawieniem. Dziś naukowcy coraz uważniej przyglądają się jego znaczeniu także w kontekście odporności, metabolizmu, reakcji organizmu na stres, skuteczności terapii czy rozwoju niektórych chorób. Mikrobiom może bowiem dostarczać ważnych informacji o stanie organizmu. Określone grupy bakterii lub cechy mikroorganizmów mogą być powiązane z konkretnymi procesami biologicznymi, chorobami albo odpowiedzią na leczenie. Takie wskaźniki – biomarkery mikrobiologiczne – mogą wspierać rozwój bardziej precyzyjnej diagnostyki, nowych terapii i medycyny personalizowanej.
Celem projektu dr. Segi jest stworzenie kompleksowej platformy do analiz i walidacji rozwiązań opartych na biomarkerach mikrobiologicznych. Nowa infrastruktura, pozyskana dzięki ponad 5 mln zł dofinansowania z MNiSW w ramach dotacji celowych na realizację inwestycji związanych z działalnością naukową, umożliwi prowadzenie zaawansowanych badań mikrobiomu, biofilmów, skuteczności terapii mikrobiomowych oraz wsparcie przy opracowywaniu testów diagnostycznych.
W ramach projektu laboratorium zostanie wyposażone między innymi w sorter komórek drobnoustrojów pracujący w warunkach bezpieczeństwa biologicznego BSL-2, cytometr do oceny żywotności komórek i pre–analizy próbek, wielodetekcyjny czytnik płytek do badania skuteczności antybiotyków oraz licznik kolonii z funkcjami opartymi na sztucznej inteligencji. Nowa infrastruktura pozwoli naukowcom analizować mikroorganizmy nie tylko na poziomie całych populacji czy szczepów:
– BioValid pozwoli nam zejść z analizą do poziomu pojedynczych komórek. To ważne, bo nawet komórki należące do tej samej populacji mogą różnić się reakcją na substancje aktywne – mówi dr Paweł Sega. Takie możliwości są szczególnie ważne w kontekście antybiotykooporności, którą Światowa Organizacja Zdrowia wskazuje jako rosnące zagrożenie dla zdrowia publicznego. Platforma BioValid będzie wspierać identyfikację bakterii opornych na dostępne terapie i poszukiwanie nowych mechanizmów ich zwalczania.
Laboratorium Diagnostyki Genetycznej i Mikrobiologicznej wspiera zespoły naukowe w Łukasiewicz – PORT, między innymi w zakresie kontroli czystości biologicznej materiałów, walidacji próbek i analiz mikrobiologicznych. Współpracuje również z firmami z sektorów medtech, farmaceutycznego, kosmetycznego, tekstylnego, weterynaryjnego i budowlanego.
Platforma BioValid pozwoli rozszerzyć ofertę laboratorium i odpowiedzieć na rosnące zapotrzebowanie rynku na precyzyjne badania mikrobiologiczne.
